第196回農林交流センターワークショップ

分子系統学の理論と実習

趣旨

農林交流センターニュース第483号(第196回農林交流センターワークショップ紹介)

遺伝子塩基配列やタンパク質アミノ酸配列の分子シーケンスデータを用いた分子系統学は、理論的にも応用面でも重要な知見を与える分野です。しかし、分子データを用いて系統樹を推定する手法は最近の進展が著しく、必要とされる基礎的知識と実践的技法の習得は必ずしも容易ではありません。とりわけ、農林水産業を含む関連分野の研究者にとっては、実際の生物に関する分子データ収集のみならず、分子進化学や統計解析の理論、さらにはゲノム情報学まで含む学際的な性格が強い系統推定論をしっかり学ぶ機会を得ることは難しいのが現状です。

本ワークショップでは、分子系統樹の的確な推定に必要な基礎的理論(進化生物学、分子進化学、統計学ならびにバイオインフォマティクス)を講義するとともに、パソコンを用いたデータ解析ならびにプログラミングのコンピュータ実習を行い、受講者が自力で系統樹を推定するために必要な技法を習得できる内容を予定しています。

あわせて、実際に農林水産研究の現場において、推定された分子系統樹を用いてどのような実践的研究が進められているのかを示し、その応用範囲と将来的可能性についても解説します。

開催日時 2015年10月28日(水)-10月30日(金)
開催場所
主催 農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波事務所
国立研究開発法人 農業環境技術研究所
対象 産学官の研究者
コーディネーター 国立研究開発法人 農業環境技術研究所
生態系計測研究領域 上席研究員 三中信宏 氏
定員 30名
参加費 無料
交通費・宿泊費 各自負担
(筑波事務所の国内研修生宿泊施設をご利用いただけます。)
宿泊施設予約の有無は、受講決定後にお伺いします。

講義と実習内容

2015年10月28日(水)

9:30-9:35
【挨拶】
[農林水産技術会議事務局 筑波事務所 研究交流課長 池田仁]
9:35-10:30
【講義】生物体系学概論
[農業環境技術研究所 三中信宏]
10:30-12:00
【講義】系統推定論入門
[農業環境技術研究所 三中信宏]
13:00-15:00
【講義】分子系統学とバイオインフォマティクス
[東京大学 岩崎渉]
15:00-17:00
【講義】進化ゲノム学と系統推定
[国立遺伝学研究所 斎藤成也]

2015年10月29日(木)

9:00-10:30
【講義・実習】分岐年代のベイズ推定
[沖縄科学技術大学院大学 井上潤]
10:30-12:00
【講義・実習】系統ネットワークの理論と応用
[茨城大学 北野誉]
13:00-15:00
【講義・実習】ゲノム情報の探索と配列のアラインメント
[農業生物資源研究所 伊藤剛]
15:00-17:00
【講義・実習】MEGA7を用いた分子系統解析
[首都大学東京 田村浩一郎]

2015年10月30日(金)

9:00-10:30
【講義・実習】分子系統樹に基づく共進化の分析
[京都大学 川北篤]
10:30-12:00
【実習】分子系統樹推定に適した配列データセットの作成
[水産総合研究センター 中央水産研究所 田辺晶史]
13:00-14:00
【実習】分子進化の統計モデリングとモデル選択
[水産総合研究センター 中央水産研究所 田辺晶史]
14:00-15:00
【実習】最尤系統樹推定と系統樹の信頼性評価
[水産総合研究センター 中央水産研究所 田辺晶史]
15:00-16:00
【実習】系統樹・系統仮説の可視化と系統仮説間の統計的比較
[水産総合研究センター 中央水産研究所 田辺晶史]
16:00-17:00
【講義】分子系統樹推定に関する質疑討論
[農業環境技術研究所 三中信宏、 水産総合研究センター 中央水産研究所 田辺晶史]

お申し込み方法

下記区分((1)または(2))により2015年9月25日(金)までにお申し込みください(必着)。

農林交流センターワークショップでは、受講者についてはコーディネーターによる選考にて決定しております(抽選ではありません)。申込書は受講者選考の際の資料となりますので、応募理由を詳細に記入くださいますようお願いします。

(1)農林水産省関係の国立研究開発法人等に所属している方

下記の関係書式から申込書等をダウンロードし、機関の取りまとめ窓口を通じてお申し込みください。
申込書とアンケートを一緒にご提出いただく必要がありますのでご注意ください。

開催要領・日程表 Wordファイル PDFファイル
申込書 Wordファイル PDFファイル
アンケート Wordファイル PDFファイル
(2)上記以外の方(大学・公立研究機関・民間企業等に所属している方)

お申し込みフォーム からお申し込みください。 ※お申し込みは終了しました。

受講者決定

2015年10月9日頃、メールにてお知らせいたします。

お問い合わせ先

農林水産技術会議事務局筑波事務所研究交流課
田中(たなか)・貝塚(かいづか)
電話:029-838-7128 メール:mail
お問い合わせフォームへ
(フォームを開く際に、一部のブラウザやOSで、警告メッセージが表示される場合には、別のブラウザやOS等をご利用ください。)

 

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